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天天滾動:貝瑞基因持續發力三代測序,攜帶者篩查市場空間廣闊
時間:2022-07-02 10:02:20

貝瑞基因

6月30日下午,貝瑞基因(000710.SZ)向外界公布了三代測序儀科研的最新進展:由公司參與完成的三代SMA(脊髓性肌萎縮癥)臨床回顧性研究成果,近期發表于分子診斷領域權威國際學術期刊 Journal of Molecular Diagnostics(即時IF=5.568)。此次研究證明,公司三代SMA相比qPCR、MLPA等傳統檢測方法,覆蓋更全面,檢測更精準。

就三代SMA的市場前景等,貝瑞基因董事長高揚接受鈦媒體采訪時表示:“可以看到SMA、CAH、地貧、FXS的單病發病風險并不高,但是在生育過程中,夫妻雙方單個人攜帶的風險其實是很高的,所以這也是為什么攜帶者篩查的市場需求較大(的原因)。”


【資料圖】

擴展性攜帶者篩查未來存在較大的市場空間。貝瑞基因市場總監趙智賢分析認為,2021年我國結婚登記人數763.6萬對,擴展性攜帶者篩查平均市場單價按2000元/例計算,理論篩查比例按照產業篩查率達到65%推算,2021年理論擴展性攜帶者篩查市場容量預計高達198.5億元。

SMA口服藥堪稱“天價”,攜帶者篩查尤為必要

據了解,此次三代SMA研究成果由中國福利會國際和平婦幼保健院與貝瑞基因聯合發表,中國福利會國際和平婦幼保健院王彥林教授和貝瑞基因毛愛平博士為這項研究的通訊作者。

公開資料顯示,SMA即脊髓性肌萎縮癥(Spinal Muscular Atrophy),是一類由脊髓前角運動神經元變性導致肌無力和肌萎縮的遺傳性肌肉疾病。SMA為嬰幼兒中第二常見的致死性常染色體隱性遺傳病,人群攜帶率為1/72-1/47,發病率為1/10000-1/6000。

雖攜帶率不算高,但一旦患上此病,只能修正治療不能根治,且昂貴的治療費用讓諸多家庭望而卻步。據山東省藥械集中采購平臺近日公告,SMA口服藥利司撲蘭主動申請降價,調整后價格為每瓶1.45萬元。按年齡體重計算,價格調整后最大使用劑量患者年治療費用將低于45萬元。

顯然,SMA攜帶者篩查才是降低該病種發病率的良方。據貝瑞基因三代事業部總監任志林介紹, SMA攜帶者分三種情況:91-94%的攜帶者只有一個正常功能的SMN1拷貝(1+0),2-5%的攜帶者含有兩個SMN1拷貝,但其中一個包含致病點突變(1+1D),另外4%為沉默型攜帶者,即有兩個SMN1拷貝,但都位于同一條染色體上(2+0)。目前qPCR、MLPA等傳統基因檢測方法無法檢測1+1D和2+0攜帶者,殘余風險最高可達1/415(1/1245-1/415)。

而三代測序具有超長讀長、無GC偏好、對高度重復等復雜區域也能夠準確測序等技術優勢,且技術成本持續下降,2025年將實現與二代測序成本持平。在此基礎上,貝瑞基因開發出三代SMA基因全面檢測技術,全球首次實現SMN1及SMN2基因近30kb全長序列的高效率三代HIFI測序。CASMA還能同時檢測SMN1及SMN2基因拷貝數、全基因范圍內致病性SNVs及Indels,并主動提示沉默型“2+0”的攜帶風險。

此次三代SMA回顧性臨床研究顯示,CASMA一次性精準檢測所有337例樣本的SMN1及SMN2基因拷貝數,對SMN1拷貝數缺失的檢測靈敏度高達100%。CASMA還成功檢測出4例會被qPCR、MLPA等傳統方法漏檢的SMN1基因點突變攜帶者(1+1D)。通過專利分析方法,CASMA直接預測出全部7例(來自4個家系)已知“2+0”型攜帶者。數據顯示,CASMA能大大改善SMA患者基因診斷及預后判斷,提高SMA新生兒基因篩查效率,將攜帶者檢出率從91-94%提高到98%以上,將殘余風險降低4-5倍。

下一站場景,一鍵解決單基因全病種檢測

事實上,三代SMA只是貝瑞基因三代測序臨床轉化體系中的一塊拼圖。不久前,由貝瑞基因提供技術支持的三代CAH(先天性腎上腺皮質增生癥)臨床回顧性研究成果,發表于檢驗醫學領域權威國際學術期刊Clinical Chemistry(即時IF=11.784)。更早一些,2021年上半年,公司發起了地中海貧血基因圖譜(TiGA)計劃。2021年7月,由貝瑞基因提供技術支持的三代地貧多中心臨床前瞻性研究成果在The Journal of Molecular Diagnostics 上發表。

此外,貝瑞基因還有21臺 PacBio Sequel II/IIe 三代測序儀儲備,目前公司已將三代測序技術觸達多種罕見病,包括三代地貧、三代CAH、三代SMA等產品相繼落地。其中,三代地貧檢測試劑盒近期取得醫療器械注冊倫理批件,進入臨床試驗階段。三代CAH和三代SMA技術則在2022年取得發明專利證書。

貝瑞基因三代事業部總監任志林接受鈦媒體采訪時表示:“把三代測序技術用在生殖健康領域、以及出生缺陷防控領域,在我們這樣一個人口基數非常龐大的國家是很有價值的,有臨床的實用性和前瞻性,而且我們也能想到這些遺傳病不只是中國人的問題,實際上是全球的問題。”

對于三代測序的下一站應用場景,“一鍵解決”單基因全病種檢測是貝瑞基因的目標。貝瑞基因介紹,因為公司的各種產品是高度兼容,所以更容易實現一次性解決多種疾病,而從一到多,準確性不會受到影響。(首發鈦媒體,作者|張海霞,編輯|崔文官)

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關鍵詞: smn1 casma

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